卷1-卷4首列运气、叙例、补遗、治法,属于总论性质;卷5-卷184为临床各科病证的论治方药,首之以诸风门,终之以乳石发动门;卷185-卷190为补益门、食治门;卷191-194为针灸门;卷195-197为符禁门;卷198-200为神仙服饵门。